Mikropölynkeräyksen toimintaperiaate on, että pölynimurin moottori pyörii suurella nopeudella, imee ilmaa imuaukosta ja tuottaa tietyn alipaineen pölykoteloon. Pöly pääsee pölylaatikossa olevaan pölypussiin lattiaharjan, suuttimen kahvan, letkun ja pääimuputken kautta. Pöly jää pölypussiin. Suodatettu ilma tulee moottoriin suodatinkerroksen kautta, joka on suojaeste, joka estää pölypussin rikkoutumisen ja pölyn imeytymisen moottoriin. Moottoriin tuleva ilma virtaa ulos moottorin kautta. Koska hiiliharja on jatkuvasti kulunut moottorin käytön aikana, siihen lisätään suodatin ennen kuin se virtaa ulos pölynimurista. Mitä hienompaa suodatinmateriaali on, sitä puhtaampaa ilmaa voidaan suodattaa, mutta sitä huonompi läpäisevyys. Tämä vaikuttaa moottorin imemään ilmamäärään ja heikentää pölynkeräystehoa. Mutta käyttäjälle mukavuus ja puhtaus ovat tärkeimpiä tekijöitä.